CY5-Amyloid β-Protein (1-46)由46个氨基酸组成的Aβ片段与近红外荧光染料CY5共价结合而成。Aβ1-46包含完整的N端（1-16位）和C端（35-46位）结构域，其中C端的疏水序列（如40-46位的GGVVIA）是纤维化核心区域。CY5的荧光发射波长（约670 nm）可穿透较厚组织，适用于活体动物模型中Aβ沉积的实时成像。研究表明，Aβ1-46在AD患者脑脊液中的浓度与疾病进展呈正相关，其聚集速率较Aβ1-40更快。标记后的蛋白需在-80℃避光保存，解冻后需通过超速离心去除潜在沉淀。在体外实验中，该标记物可用于筛选抑制Aβ纤维化的化合物，或通过荧光共振能量转移（FRET）技术分析Aβ寡聚体构象变化。
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