CY3-RKRSRAEA-NH2由花菁素3（Cy3）荧光染料与九肽序列RKRSRAEA-NH2通过共价键偶联形成。Cy3属于吲哚菁类染料，其荧光发射波长位于可见光区，具有较好的光稳定性和化学稳定性，适用于生物分子标记及荧光成像。多肽部分包含多个碱性氨基酸（精氨酸、赖氨酸），赋予其潜在的细胞穿透性或蛋白结合能力，而酰胺化修饰（NH2）则增强了肽链的稳定性。该标记物常用于蛋白质相互作用研究、细胞内定位追踪及分子动力学分析，通过荧光信号可视化目标分子的动态行为。其合成工艺需精确控制染料与肽链的偶联位点，以确保荧光性能与生物活性的双重保留。
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